เป็นถ้ำที่เกิดขึ้นเองตามธรรมชาติ ในพื้นที่หินปูน ชั้นหนา เนื้อแน่น เมื่อน้ำฝนไหลผ่าน ไปตามรอยแยก ของหินปูน เกิดการละลายตัว ของหินปูนหรือ หินไดโดโลไมต์ ทำปฏิกิริยากับน้ำ ในธรรมชาติ เกิดเป็นโพรง และกลายเป็น ถ้ำมากมาย
ถ้ำ เป็นลักษณะเด่น ของภูมิลักษณ์คาร์สต์ ที่เกิดจากการกัดเซาะ ผุพังทั้งทางกายภาพ และทางเคม ีเกิดในภูเขาหินปูน เนื่องจากหินปูนละลายน้ำได้ง่าย เมื่อหินปูนทำปฏิกิริยา กับน้ำฝน และน้ำใต้ดิน ที่มีสภาพเป็นกรดอ่อนๆ เกิดการละลายออก ของหินทำให้สึกกร่อนเป็นโพรง โดยมักเกิดตามรอยแตก ที่มีอยู่ในหิน ซึ่งเนื้อหินจะถูกละลาย ไปตามรอยแตกที่มีขนาดกว้าง ขึ้นกลายเป็นถ้ำ ถ้าหินปูนมีรอยแตกมาก และถูกชะล้างละลาย ออกไปมากจนทำให้ หินพังจากด้านบนลงไป เกิดเป็นหลุม เรียกว่า หลุมยุบ ภายในถ้ำ ที่มีความชื้น และอุณหภูมิที่พอเหมาะ มักมีน้ำที่มีสารละลายปูน ไหลหยดอยู่ตามพื้น และเพดานถ้ำ เกิดเป็นหินงอก หินย้อย ในบางแหล่งน้ำละลายปูน ตกผลึกเป็นผลึกแร่ แคลไซต์สวยงามมาก
