เกาะเต่า เกาะนางยวน เป็นเกาะขนาดเล็กเมื่อเทียบกับเกาะข้างเคียง เช่น เกาะพะงัน เกาะสมุย ลักษณะทางธรณีวิทยาเป็นหินแกรนิต ดินที่เกิดจากหิน ชนิดนี้จึงเป็น ดินทรายเนื้อหยาบ มีความสามารถ ในการอุ้มน้ำต่ำ ป่าไม้ที่จึงเป็นพื้นที่ ที่มีความสำคัญ ในการรักษาความชุ่มชื้นของพื้นดิน และเป็นแหล่งต้นน้ำที่สำคัญของเกาะ
การท่องเที่ยวแห่งประเทศไทย และสถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งประเทศไทย (2537) ได้จำแนกสังคมพืชของเกาะเต่า เป็น ป่าดิบแล้ง ป่าเบญจพรรณแล้ง ป่าข่อยหนาม และป่าชายหาด ไว้ดังนี้